第一，海关发票的填制，重点在于证明原产地和商品的FOB价值，所以，“产地”栏不能漏填。如果以CIF或者CFR成交的商品，必须正确计算运费及保险费，如果估算过高，将受进口国海关的指责，或者退回重新填写。特别是来证要求提供保险单账单，或将实际运费加注在海运提单上时，海关发票上的保险费和运费金额，必须要和实际上付出的费用一致；
第二，签字时，卖方必须以个人名义签字，要求用手签写，不得以公司名义签章；
第三，在填制海关发票时，如果有错打以及涂改的地方，不能加盖校对章，必须由出票签字人用钢笔加注小签；
第四，海关发票的抬头人一般应填写收货人。如果收货人不在货物的到达港，则应填写到达地被通知人的名称；
第五，海关发票上的金额、数量、毛净重等项目，必须与商业发票、提单上所填写的内容完全一致；
第六，海关发票各栏目都必须填写，无实际内容的可注上“NIL”或者“N/A”(Not Applicable)或打虚线划掉，不能在海关发票上留有空白栏目。
第七，需提供海关发票的国家都有不同的格式，名称也不尽相同，填制时必须根据不同的格式仔细填制。如果格式用错，进口国海关将拒绝接受。
第八，海关发票格式不一,不同国家或地区有其本国或本地区规定的专门格式,来证内一般有规定,切勿用错格式.
第九，凡是商业发票上和海关发票上共有的项目和内容,必须与商业发票保持一致,不得相互矛盾.
第十，关于海关发票价格构成的填写,海关发票一般均要求列明构成该价格的各项费用,若按CIF价格条件成交,则应分别列明运费,保险费和FOB价格,这三者的总和应与CIF货值相等.此外,尚应列明包装费,打包费,货物运至装运港码头的搬运费等费用."出口国当地市场价格"以本国人民币表示.但该栏价值应比FO B价格低4￣5%左右,否则会被认为是低价倾销.
第十一，有些国家的格式有"费用栏",填写时应尽量填全.如果有"是否包括在国内市场价内"的要求,也应给予表明.如果填"不包括"或"包括"都直接影响"国内市场价"的计算额,应注意计算的正确.
第十二，关于海关发票的签署,要求以个人名义用手签方式签署的海关发票,则不盖公章;如需要监签人(证明人),也要手签.海关发票的签字人或其他单据的签字人不得作为监签人.海关发票如有涂改,须由原缮制人用钢笔小签,不能加盖校对印章,也不得由监签人代行.
第十三，海关发票的"原产地"一项应填"中国"字样,切勿漏掉.
第十四，海关发票是用外文印制的,填写时一般要用相应的外文进行,要求文字简
第十五，西非海关发票中，有以个人名义签字的，要求填写见证人，签字则该“见证人”不能出现在其他出口单据上，即签字人与见证人是2个独立的身份出现方有效。
